呼伦贝尔得名于呼伦和贝尔两大湖泊。呼伦的蒙语大意为“水獭”，贝尔的蒙语大意为“雄水獭”，因为过去这两个湖盛产水獭。

当地民间有一个关于“呼伦贝尔”名称来历的优美的传说：很久很久以前，草原上一个勇敢的蒙古族部落里有一对情侣，女的能歌善舞，才貌双全，叫呼伦；男的力大无比，能骑善射，叫贝尔。

她们为了拯救草原，追求爱情，与草原上的妖魔奋勇搏杀，女的化作湖水淹死了众妖，男的为寻找女的勇敢投湖，于是，她们双双化作了世世代代滋润草原和她的子民们的呼伦、贝尔二湖。